Đặc thù các vụ án do Cục An ninh điều tra, Bộ Công an thụ lý điều tra đều là những vụ đặc biệt nghiêm trọng, phức tạp như các vụ án xâm phạm an ninh quốc gia; vụ án thuộc diện Ban Chỉ đạo Trung ương về phòng, chống tham nhũng, lãng phí, tiêu cực theo dõi chỉ đạo; vụ án liên quan đến nội bộ, kinh tế, tham nhũng, chức vụ được lãnh đạo Đảng, Nhà nước và dư luận xã hội đặc biệt quan tâm… Vì vậy, quá trình điều tra, khám phá gặp rất nhiều khó khăn. Song với tinh thần dám nghĩ, dám làm, dám chịu trách nhiệm; thận trọng, khách quan, không làm oan người vô tội, không để lọt tội phạm, CBCS Cục An ninh điều tra đã làm rõ nhiều vụ án, góp phần đảm bảo an ninh quốc gia.